艾克斯追击虚空怪兽格利扎，将其掷入太阳引发超级耀斑，导致地球内部的火花人偶纷纷实体化。人类成立究极抗灾害地球护卫队UNVER，招募梵顿星人格尔曼等友好外星人升级装备。十五年后，吉奥队员大空大地在战斗中被迷之声指引结合神秘之光成为艾克斯，能够化虚拟怪兽为怪兽装甲（哥莫拉装甲、艾雷王装甲、贝蒙斯坦装甲、杰顿装甲）。奥特战士赠予究极赛罗装甲、麦克斯装甲。格利扎复活，不断向地球投掷暗黑雷暴使怪兽凶暴化。艾克斯被暗剑迪玛伽击败，大地从数据世界寻回艾克斯，激活艾克斯头镖进阶超越形态，后接受翔训练掌握剑术。格利扎摧毁宇宙玛斯凯迪号后吸收美国分部火花人偶化为人形，艾克斯冲入其体内自爆摧毁。格利扎吸收日本分部火花人偶进阶最终形态。艾克斯从XIO队友们的思念中复活，借全部虚拟怪兽联结诞生的混合装甲击败格利扎。
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